上一節我們講到臭氧的物理化學常識，臭氧，化學分子式為O3，含有3個氧原子。在常溫下很不穩定，極易分解，生成氧氣（又稱氧分子，化學分子式為O2）和氧原子。對于氧氣我們大家都很熟悉了，那是維持我們生命的氣體，在這里不再贅述。

臭氧其實是以氧原子的氧化作用來破壞微生物膜的結構，以實現殺菌作用。因此臭氧消毒原理可以認為是一種氧化反應。

臭氧對細菌和病毒的滅活機理如下：

(1)臭氧對細菌滅活的機理：

臭氧對細菌的滅活反應總是進行的很迅速，與其它殺菌劑不同的是：臭氧能與細菌細胞壁脂類的雙鍵反應, 穿入菌體內部，作用于蛋白和脂多糖，改變細胞的通透性，從而導致細菌死亡。臭氧還作用于細胞內的核物質，如 核酸中的嘌呤和嘧啶破壞 DNA。臭氧首先作用于 細胞膜，使膜構成成份受損傷，而導致 新陳代謝障礙，臭氧繼續滲透穿透膜，而破壞膜內脂蛋白和脂多糖，改變細胞的通透性，導致細胞溶解、死亡。

(2)臭氧對病毒的滅活機理：

臭氧對病毒的作用首先是病毒的衣體殼蛋白的四條多肽鏈，并使RNA受到損傷，特別是形成它的蛋白質。噬菌體被臭氧氧化后，電鏡觀察可見其表皮被破碎成許多碎片，從中釋放出許多核糖核酸，干擾其吸附到寄存體上。臭氧殺菌的徹底性是不容懷疑的。